در خصوص مشکلات تولید و صادرات گیاهان دارویی در ایران میتوان به افزایش بهای تمام شده محصولات نسبت به کشورهایی مانند هند، عدم وجود مرجع مشخص قیمت گذاری، عدم ارایه آموزش های مناسب به کشاورزان برای تولید محصولات با درصد کمتری از کودهای شیمیایی، خشکسالی های اخیر، وجود دلالان و واسطه ها در بازار داخلی و خارجی، عدم وجود دانش و تکنولوژی نوین برای تولید و فرآوری در این صنعت را نام برد که باعث شده ایران از تجارت این ثروت عظیم و خدادادی نسبت به بقیه کشورها سهم اندکی دارا باشد.
از دیگر مشکلات در این بخش عدم برنامه ریزی دولت در زمینه ایجاد فرصت در شناسایی بازارهای خارجی،عدم آموزش های تخصصی صادر کنندگان توسط نهادهای مربوط از جمله اتاق بازرگانی, عدم ارتباط مستقیم تولید کنندگان و صادر کنندگان با مشتریان اصلی و فروش به واسطه ها می توان اشاره کرد.
اگر کشاورزها از زمان کاشت تا برداشت تحت نظر کارشناسان آموزش های لازم را دریافت کنند و بخش خصوصی و دولتی حمایت لازم را انجام دهد و از دستگا ههای بروز در هنگام برداشت و سورت محصول استفاده شود این امر باعث تولید محصولات ارگانیک و بهداشتی با کیفیت بالا خواهد شد و بهای تمام شده محصول نیز پایین خواهد آمد.
همچنین گیاهان دارویی که کشاورزها تولید میکنند در انبارهای فاقد استاندارد بهداشتی نگه داری می شوند.
گروه بازرگانی ملکی با استفاده از تجارب متخصصان داخلی و بین المللی در حوزه کشاورزی مدرن، یکی از بزرگترین شرکت های مشاوره در زمینه کشت گیاهان دارویی صادراتی، فرآوری گیاهان دارویی، راه اندازی واحدهای صنعتی
اسانس گیری است که در زمینه کشت و فروش خدمات مشاوره ارایه می دهد.